医院现拥有四川省级甲级重点学科1个儿科，乙级重点学科2个妇产科、产科，省级甲级重点专科8个（更年期妇女保健综合指导中心、儿童急救与重症医学科、小儿呼吸内科、新生儿科、妇科、儿童心脏内科、肾脏病学（小儿方向）、儿科（消化病学方向）），市级重点学科9个（小儿血液/肿瘤病学、小儿神经精神病学、妇产科、小儿急救与重症医学科、新生儿科、儿童呼吸内科、产前诊断（实验室）、儿童心脏科、儿童肾脏内科），市级重点学科（实验室）建设项目6个（儿童消化科、儿童保健科、生殖健康与不孕症科、小儿外科学、小儿遗传内分泌代谢科、乳腺科）。省级、市级重点学科（专科）共26个，学科带头人13人次。
    学科建设已作为提升医院核心竞争力的重要手段，打造重点专科、学科集群，利用我院儿科、妇产科的专业优势，并采取多学科合作的模式，强化优势，与同类医院形成错位发展，带动医院整体临床技术水平的提升，带动了全院医、教、研工作的全面发展，促进医院发展的上升趋势，为打造高水平妇女儿童专科医院奠定坚实的基础。